O Colégio Efanor dispõe de um Serviço de Psicologia e Apoios Educativos que integra três psicólogas e duas professoras de Educação Especial, estruturando-se em função de quatro eixos fundamentais:
No caso de alunos referenciados (pelos encarregados de educação ou pela equipa docente) e/ou alunos com Necessidades Educativas Específicas, o Serviço de Psicologia e Apoios Educativos poderá disponibilizar apoios pedagógicos individuais por parte das professoras de Educação Especial. Os apoios especializados serão concertados com os encarregados de educação e por si validados, ficando sujeitos à aplicação de tarifário próprio. No Colégio Efanor a diferenciação curricular e pedagógica é a palavra-chave que norteia as práticas curriculares dos docentes, contribuindo para o sucesso ambicionado para todos e cada um dos alunos.